洞窟物语讲述的是主角在一个积水的洞窟醒来，一切都不清楚，随着前行，大量的信息接踵而至：神秘的通讯、兔子一样的生物咪咪卡、可怕的赤之花、行踪神秘又不合群的咪咪卡“数”、残暴的博士和他的手下，唯有不断前行，才能解开所有谜团。而等待着主角的，是科幻与奇幻相交汇的壮大世界，以及梦幻而残酷的现实，能否阻止战争，能否拯救重要的人？能否了解到真相？一切都在玩家手中。